Servizi infrastrutturali di base della piattaforma informatica

ICAR CNR

Descrizione del tipo di analisi

Elaborazione ed analisi di immagini istologiche digitalizzate provenienti da vetrini. La maggior parte delle analisi tratta immagini con colorazione in Ematossilina-Eosina (H&E), ma alcune elaborazioni possono essere effettuate anche su immagini Immunoistochimiche (IHC).
1. Analisi di immagine digitale istologica (IHC/H&E) attraverso l’utilizzo di QuPath (visualizzazione, annotazione manuale/semiautomatica di zone di interesse, segmentazione automatica di nuclei, calcolo caratteristiche morfologiche e di intensità) - Servizio usufruibile da remoto dall’utente finale (in progress)
2. Processamento dell’immagine digitale istologica (H&E) mediante utilizzo di tecniche base di elaborazione dell’immagine (thresholding, trasformazione nei vari spazi di colore, edge detection, operazioni morfologiche) - Servizio usufruibile da remoto dall’utente finale (in progress)
3. Normalizzazione immagine digitale istologica (H&E) (metodo Macenko)
4. Classificazione immagine digitale istologica (H&E) di cancro al seno in 2 classi (benigno/maligno) o 3 classi (benigno, maligno/atipico)
5. Classificazione immagine digitale istologica (H&E) di cancro ai polmoni in 3 classi (normale/adenocarcinama/squamocellulare)

Output atteso

1. Immagine visualizzata/elaborata ed eventuali caratteristiche estratte
2. Immagine elaborata con la(le) tecnica(che) scelta(e)
3. Immagine normalizzata
4./5. Classe relativa all’immagine sotto esame e visualizzazione delle zone che hanno portato alla scelta della classe di output

Costi



Tempi per l’analisi